Пробовала. Стала удалять и вставлять по Вашему методу. Нашлось проблемное место в главной сборке. Но дело в том, что вставлять в это место подсборку, не только нужную, но и любую другую получалось, а проекцию снять уже нет. Поэтому пришла к выводу, что TF не может обработать такой объем.
На этом форуме прочитала, что при массивных сборках возникают проблемы - долго пересчитывает и т.д. Может все дело в нерациональном использовании операций при построении подсборок, т.е. один и тот же элемент можно построить разными методами и вес его файла будет значительно отличаться.